Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A20O43772 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC25A20O43772 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms