Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HTATSF1O43719 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HTATSF1O43719 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HTATSF1O43719 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms