Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP2AO43633 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMP2AO43633 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP2AO43633 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms