Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TIMM44O43615 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TIMM44O43615 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms