Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC8O43402 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMC8O43402 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC8O43402 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC8O43402 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC8O43402 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC8O43402 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC8O43402 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC8O43402 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC8O43402 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC8O43402 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC8O43402 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC8O43402 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC8O43402 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC8O43402 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMC8O43402 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMC8O43402 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMC8O43402 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMC8O43402 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMC8O43402 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMC8O43402 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMC8O43402 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMC8O43402 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMC8O43402 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMC8O43402 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMC8O43402 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMC8O43402 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMC8O43402 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMC8O43402 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMC8O43402 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMC8O43402 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMC8O43402 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMC8O43402 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMC8O43402 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMC8O43402 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMC8O43402 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC8O43402 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC8O43402 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC8O43402 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC8O43402 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC8O43402 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC8O43402 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC8O43402 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC8O43402 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC8O43402 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC8O43402 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC8O43402 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMC8O43402 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC8O43402 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC8O43402 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC8O43402 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC8O43402 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC8O43402 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC8O43402 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC8O43402 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC8O43402 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC8O43402 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC8O43402 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC8O43402 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC8O43402 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC8O43402 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC8O43402 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC8O43402 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC8O43402 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC8O43402 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC8O43402 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC8O43402 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC8O43402 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC8O43402 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC8O43402 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC8O43402 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC8O43402 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC8O43402 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC8O43402 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC8O43402 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC8O43402 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC8O43402 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC8O43402 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC8O43402 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC8O43402 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC8O43402 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC8O43402 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC8O43402 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC8O43402 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EMC8O43402 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EMC8O43402 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMC8O43402 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC8O43402 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC8O43402 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EMC8O43402 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC8O43402 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMC8O43402 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC8O43402 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC8O43402 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC8O43402 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC8O43402 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC8O43402 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC8O43402 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EMC8O43402 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMC8O43402 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms