Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRGAP3O43295 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRGAP3O43295 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms