Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHGDHO43175 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHGDHO43175 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHGDHO43175 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms