Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIPA1L1O43166 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SIPA1L1O43166 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIPA1L1O43166 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms