Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PJA2O43164 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PJA2O43164 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PJA2O43164 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PJA2O43164 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PJA2O43164 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PJA2O43164 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PJA2O43164 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PJA2O43164 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PJA2O43164 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PJA2O43164 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PJA2O43164 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PJA2O43164 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PJA2O43164 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PJA2O43164 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PJA2O43164 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PJA2O43164 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PJA2O43164 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PJA2O43164 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PJA2O43164 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PJA2O43164 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PJA2O43164 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PJA2O43164 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA2O43164 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA2O43164 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA2O43164 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA2O43164 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA2O43164 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA2O43164 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA2O43164 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA2O43164 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA2O43164 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA2O43164 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA2O43164 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PJA2O43164 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA2O43164 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA2O43164 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA2O43164 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA2O43164 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA2O43164 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA2O43164 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA2O43164 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA2O43164 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA2O43164 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA2O43164 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA2O43164 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PJA2O43164 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA2O43164 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA2O43164 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA2O43164 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA2O43164 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA2O43164 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA2O43164 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA2O43164 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA2O43164 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PJA2O43164 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PJA2O43164 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PJA2O43164 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PJA2O43164 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PJA2O43164 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA2O43164 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA2O43164 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA2O43164 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA2O43164 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA2O43164 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA2O43164 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA2O43164 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA2O43164 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA2O43164 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA2O43164 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA2O43164 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PJA2O43164 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PJA2O43164 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PJA2O43164 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PJA2O43164 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PJA2O43164 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PJA2O43164 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PJA2O43164 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA2O43164 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA2O43164 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA2O43164 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA2O43164 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA2O43164 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA2O43164 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PJA2O43164 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms