Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD3EAPO15446 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD3EAPO15446 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD3EAPO15446 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms