Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHUKO15111 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHUKO15111 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHUKO15111 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHUKO15111 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHUKO15111 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHUKO15111 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHUKO15111 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHUKO15111 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHUKO15111 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHUKO15111 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHUKO15111 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHUKO15111 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHUKO15111 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHUKO15111 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHUKO15111 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHUKO15111 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHUKO15111 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHUKO15111 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHUKO15111 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHUKO15111 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHUKO15111 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHUKO15111 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHUKO15111 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHUKO15111 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHUKO15111 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHUKO15111 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHUKO15111 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHUKO15111 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHUKO15111 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHUKO15111 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHUKO15111 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHUKO15111 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHUKO15111 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHUKO15111 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHUKO15111 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHUKO15111 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHUKO15111 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHUKO15111 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHUKO15111 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHUKO15111 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHUKO15111 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHUKO15111 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHUKO15111 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHUKO15111 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHUKO15111 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHUKO15111 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHUKO15111 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHUKO15111 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHUKO15111 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHUKO15111 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHUKO15111 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHUKO15111 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHUKO15111 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHUKO15111 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHUKO15111 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHUKO15111 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHUKO15111 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHUKO15111 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHUKO15111 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHUKO15111 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHUKO15111 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHUKO15111 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHUKO15111 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHUKO15111 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHUKO15111 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHUKO15111 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHUKO15111 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHUKO15111 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHUKO15111 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHUKO15111 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHUKO15111 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHUKO15111 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHUKO15111 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHUKO15111 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHUKO15111 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHUKO15111 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHUKO15111 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHUKO15111 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHUKO15111 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHUKO15111 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHUKO15111 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHUKO15111 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHUKO15111 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHUKO15111 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHUKO15111 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms