Protein–RNA interactions for Protein: O14556

GAPDHS, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, testis-specific, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHSO14556 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAPDHSO14556 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GAPDHSO14556 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPDHSO14556 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms