Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFRA2O00451 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFRA2O00451 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GFRA2O00451 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms