Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3FO00303 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3FO00303 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms