Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX39AO00148 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX39AO00148 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX39AO00148 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX39AO00148 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX39AO00148 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX39AO00148 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX39AO00148 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX39AO00148 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX39AO00148 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX39AO00148 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX39AO00148 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX39AO00148 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX39AO00148 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX39AO00148 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DDX39AO00148 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX39AO00148 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms