Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC2LH3BP13 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC2LH3BP13 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms