Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRRT4C9JH25 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT4C9JH25 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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