Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRDCB7Z8K6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRDCB7Z8K6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms