Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
B4E171 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
B4E171 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
B4E171 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4E171 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4E171 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4E171 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4E171 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4E171 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4E171 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4E171 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4E171 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4E171 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4E171 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4E171 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4E171 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4E171 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4E171 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4E171 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4E171 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4E171 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4E171 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4E171 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4E171 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
B4E171 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4E171 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4E171 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4E171 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4E171 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4E171 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4E171 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4E171 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4E171 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4E171 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4E171 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4E171 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4E171 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4E171 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4E171 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4E171 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4E171 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4E171 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4E171 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4E171 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4E171 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4E171 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4E171 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4E171 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4E171 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4E171 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
B4E171 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
B4E171 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4E171 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4E171 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4E171 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4E171 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4E171 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4E171 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4E171 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4E171 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4E171 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4E171 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4E171 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4E171 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4E171 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4E171 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4E171 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4E171 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4E171 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4E171 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4E171 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4E171 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
B4E171 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4E171 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4E171 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
B4E171 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4E171 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4E171 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4E171 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4E171 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4E171 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4E171 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4E171 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4E171 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4E171 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4E171 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4E171 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4E171 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4E171 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4E171 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4E171 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
B4E171 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
B4E171 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4E171 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4E171 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4E171 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4E171 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4E171 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4E171 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4E171 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms