Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF487B1APH4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF487B1APH4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF487B1APH4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms