Protein–RNA interactions for Protein: A8MVA2

KRTAP9-6, Keratin-associated protein 9-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-6A8MVA2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP9-6A8MVA2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms