Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
YJEFN3A6XGL0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
YJEFN3A6XGL0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YJEFN3A6XGL0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms