Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP27XA6NNY8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP27XA6NNY8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP27XA6NNY8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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