Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL13PA6NNM8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTLL13PA6NNM8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTLL13PA6NNM8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms