Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM23A6NLE4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM23A6NLE4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms