Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP5A6NIR3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AGAP5A6NIR3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms