Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SERINC4A6NH21 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC4A6NH21 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms