Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC160A6NGH7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms