Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLHL33A6NCF5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL33A6NCF5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms