Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRBA1A5PL33 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRBA1A5PL33 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms