Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SSPOA2VEC9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SSPOA2VEC9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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