Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC162PA2VCL2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC162PA2VCL2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms