Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMD3A2A2Y4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms