Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SYCE3A1L190 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCE3A1L190 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms