Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
E2F8A0AVK6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms