Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
USP20Q9Y2K6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms