Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HPS5Q9UPZ3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HPS5Q9UPZ3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.2 ms