Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AGAP1Q9UPQ3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms