Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TNFSF18Q9UNG2 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
TNFSF18Q9UNG2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms