Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
C6orf48Q9UBA6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms