Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms