Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms