Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCC13Q9NSE7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms