Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRHQ9HD43 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRHQ9HD43 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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