Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
POLR2J2Q9GZM3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 373.1 ms