Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM5Q9C035 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM5Q9C035 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms