Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms