Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AGAP3Q96P47 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms