Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BORCS6Q96GS4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms