Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
SMIM12Q96EX1 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms